mit der Konfigurationsvariable "expose_s9y" schaltet man die ganzen Versionsnummer im Blog von s9y und PHP aus. Das macht es auch ganz super, nur in den Meta Angaben steht die Version immer noch drin.
zu entfernen. Ist leider nicht updatesicher, wird also beim nächsten s9y-Update überschrieben, wenn es ein mit dem Kern ausgeliefertes Template ist. Hat Dein Template keine index.tpl, kopierst Du /templates/default/index.tpl nach /templates/DEIN_TEMPLATE/index.tpl und bearbeitest die kopierte index.tpl.